Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gsc2P56916 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms