Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpbP50405 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SftpbP50405 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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