Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gli1P47806 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gli1P47806 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gli1P47806 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gli1P47806 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gli1P47806 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gli1P47806 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gli1P47806 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gli1P47806 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms