Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TfamP40630 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TfamP40630 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TfamP40630 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TfamP40630 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TfamP40630 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TfamP40630 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TfamP40630 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
TfamP40630 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms