Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TtlP38585 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TtlP38585 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TtlP38585 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms