Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cd28P31041 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd28P31041 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd28P31041 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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