Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NdnP25233 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NdnP25233 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NdnP25233 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms