Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Ggta1P23336 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ggta1P23336 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
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Ggta1P23336 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ggta1P23336 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ggta1P23336 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ggta1P23336 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ggta1P23336 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ggta1P23336 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ggta1P23336 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ggta1P23336 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms