Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P18528 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
P18528 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P18528 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P18528 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms