Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RhoP15409 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RhoP15409 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RhoP15409 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RhoP15409 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RhoP15409 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RhoP15409 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RhoP15409 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RhoP15409 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RhoP15409 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RhoP15409 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RhoP15409 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RhoP15409 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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