Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms