Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa1P11477 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Defa1P11477 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Defa1P11477 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms