Protein–RNA interactions for Protein: P01729

Ig lambda-2 chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01729 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01729 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01729 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01729 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01729 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01729 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01729 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01729 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01729 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01729 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01729 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P01729 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P01729 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01729 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01729 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01729 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01729 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01729 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01729 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01729 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01729 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01729 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01729 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01729 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01729 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01729 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms