Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Ccl20O89093 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Ccl20O89093 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Ccl20O89093 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Ccl20O89093 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Ccl20O89093 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Ccl20O89093 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Ccl20O89093 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Ccl20O89093 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Ccl20O89093 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Ccl20O89093 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Ccl20O89093 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl20O89093 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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