Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sap30O88574 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sap30O88574 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sap30O88574 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sap30O88574 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms