Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Psmb10O35955 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Psmb10O35955 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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Psmb10O35955 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Psmb10O35955 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb10O35955 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 624.4 ms