Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Prrt1O35449 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Prrt1O35449 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Prrt1O35449 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Prrt1O35449 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Prrt1O35449 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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