Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Smad6O35182 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Smad6O35182 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms