Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm8888J3QPX5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm8888J3QPX5 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm8888J3QPX5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm8888J3QPX5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm8888J3QPX5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm8888J3QPX5 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm8888J3QPX5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm8888J3QPX5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm8888J3QPX5 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm8888J3QPX5 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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