Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rarres1F6ZIS7 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rarres1F6ZIS7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rarres1F6ZIS7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rarres1F6ZIS7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rarres1F6ZIS7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rarres1F6ZIS7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rarres1F6ZIS7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rarres1F6ZIS7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rarres1F6ZIS7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rarres1F6ZIS7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rarres1F6ZIS7 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rarres1F6ZIS7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rarres1F6ZIS7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rarres1F6ZIS7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rarres1F6ZIS7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rarres1F6ZIS7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rarres1F6ZIS7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rarres1F6ZIS7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rarres1F6ZIS7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rarres1F6ZIS7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rarres1F6ZIS7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rarres1F6ZIS7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rarres1F6ZIS7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rarres1F6ZIS7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rarres1F6ZIS7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms