Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rdh16f1E9Q9P8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms