Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Clip3B9EHT4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Clip3B9EHT4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Clip3B9EHT4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Clip3B9EHT4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Clip3B9EHT4 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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