Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scml2B1AVB3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scml2B1AVB3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scml2B1AVB3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scml2B1AVB3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scml2B1AVB3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scml2B1AVB3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Scml2B1AVB3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scml2B1AVB3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms