Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M5A7VMS3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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