Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf39A2RT81 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf39A2RT81 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf39A2RT81 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf39A2RT81 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf39A2RT81 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rnf39A2RT81 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rnf39A2RT81 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rnf39A2RT81 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rnf39A2RT81 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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