Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syndig1A2ANU3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syndig1A2ANU3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms