Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramel3A2AHA7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms