Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5538W4VSP6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5538W4VSP6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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