Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms