Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Homer1Q9Z2Y3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms