Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Trip6Q9Z1Y4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms