Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Nek3Q9R0A5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nek3Q9R0A5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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