Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gpc6Q9R087 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Gpc6Q9R087 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Gpc6Q9R087 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Gpc6Q9R087 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Gpc6Q9R087 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gpc6Q9R087 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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