Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ap3m1Q9JKC8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ap3m1Q9JKC8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms