Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cacna1fQ9JIS7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cacna1fQ9JIS7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cacna1fQ9JIS7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cacna1fQ9JIS7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cacna1fQ9JIS7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cacna1fQ9JIS7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cacna1fQ9JIS7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cacna1fQ9JIS7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cacna1fQ9JIS7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cacna1fQ9JIS7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cacna1fQ9JIS7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cacna1fQ9JIS7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cacna1fQ9JIS7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cacna1fQ9JIS7 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cacna1fQ9JIS7 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cacna1fQ9JIS7 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cacna1fQ9JIS7 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cacna1fQ9JIS7 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cacna1fQ9JIS7 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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