Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

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Length 1,160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Aff4Q9ESC8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Aff4Q9ESC8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Aff4Q9ESC8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Aff4Q9ESC8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Aff4Q9ESC8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Aff4Q9ESC8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Aff4Q9ESC8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Aff4Q9ESC8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Aff4Q9ESC8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Aff4Q9ESC8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Aff4Q9ESC8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Aff4Q9ESC8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Aff4Q9ESC8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Aff4Q9ESC8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Aff4Q9ESC8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Aff4Q9ESC8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Aff4Q9ESC8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Aff4Q9ESC8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Aff4Q9ESC8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Aff4Q9ESC8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Aff4Q9ESC8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Aff4Q9ESC8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Aff4Q9ESC8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Aff4Q9ESC8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Aff4Q9ESC8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Aff4Q9ESC8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Aff4Q9ESC8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Aff4Q9ESC8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Aff4Q9ESC8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Aff4Q9ESC8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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