Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzd9Q9D9M4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
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Pdzd9Q9D9M4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Pdzd9Q9D9M4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Pdzd9Q9D9M4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Pdzd9Q9D9M4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd9Q9D9M4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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