Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syce1Q9D495 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms