Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Krt20Q9D312 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms