Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpusd4Q9CWX4 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Rpusd4Q9CWX4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Rpusd4Q9CWX4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd4Q9CWX4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms