Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pfdn1Q9CWM4 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn1Q9CWM4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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