Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Atp6v0e1Q9CQD8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Atp6v0e1Q9CQD8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Atp6v0e1Q9CQD8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Atp6v0e1Q9CQD8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Atp6v0e1Q9CQD8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Atp6v0e1Q9CQD8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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