Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms