Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hps4Q99KG7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hps4Q99KG7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms