Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nlgn1Q99K10 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlgn1Q99K10 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms