Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp3Q91W36 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp3Q91W36 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp3Q91W36 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp3Q91W36 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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