Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top1mtQ8R4U6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Top1mtQ8R4U6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Top1mtQ8R4U6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Top1mtQ8R4U6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Top1mtQ8R4U6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Top1mtQ8R4U6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Top1mtQ8R4U6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Top1mtQ8R4U6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Top1mtQ8R4U6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Top1mtQ8R4U6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms