Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms