Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Vmn1r188Q8K3N2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Vmn1r188Q8K3N2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Vmn1r188Q8K3N2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vmn1r188Q8K3N2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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