Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Usp27Q8CEG8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Usp27Q8CEG8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Usp27Q8CEG8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Usp27Q8CEG8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Usp27Q8CEG8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Usp27Q8CEG8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Usp27Q8CEG8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Usp27Q8CEG8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Usp27Q8CEG8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Usp27Q8CEG8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Usp27Q8CEG8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Usp27Q8CEG8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Usp27Q8CEG8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp27Q8CEG8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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